Габитус
Возможно, евреи были безопасной политически жертвой, но я думаю, что причина в том, что Сталин понимал их потенциал, который можно использовать уже против него.
Потому что советские евреи продолжали поддерживать свою идентичность, традиции и религию, а значит встречались и общались, поддерживали отношения между своими, поэтому возможность для заговоров была. А репрессии в общем-то были опережающими часто. Пока все это работало во благо борьбы с царским режимом, Сталина все устраивало. Среди евреев революционеров было много, и сочувствующих много. И это объяснимо - в массе они были грамотны и обделены правами.

Но гражданская закончилась, отжим власти закончился, и буйных нужно было зачищать. А после буйных были те, кто сохранял идентичность отличную от советской, и при этом был потенциально опасен.