Хорошая у вас теория. Но у неё есть один весомый изъян. Вы исходите из того, что Данзо действовал из благих намерений, во славу деревни. Тогда, как и указали выше, всё не сходиться : что мешало ему приказать вырезать самых сильных/буйных. А если предположить что им двигало внутреннее гадство? Ведь кто же создал Пейна? Кто проводил этнические чистки с элементами геноцида? Кто проводил незаконные генетические эксперементы вместе с разыскиваемым террористом? Тогда всё встаёт на свои места.