Исповедник
Данзо прекрасно знает способности Итачи, т.к. тот был под его началом (пусть и не официально) довольно длительное время. Знает про его имбовость.
Единственный известный обладатель МШ Шисуи уже в могилке. Данзо об его обезвреживании позаботился. Может, конечно, выползти кто-то ещё имбовей, как черт из коробочки, но тогда операция тем более того стоит.
Так что Итачи мог очень сильно навредить клану, просто катастрофически.

Ну а почему не на зачинщиков восстания - ну так очевидно. Для Итачи разумней ликвидировать втихаря самых сильных, а не резать младенцев, пока не запалят. А там шум-гам-драка.
Итачи, запланированному в расход, знать о деталях не надо. Режь клан и всё.
Будет резать младенцев - ок, тем злее будут имбы, тем сильнее начнётся мочилово, а Учих всё равно не очень жалко.

Я же говорю, единственный вариант, который был вообще маловероятный, что Учиха окажутся настолько сосунками, что Итачи таки сможет их вырезать.


А вот это нит. 10 лет с резни до 5 каге не прошло (а это время перезарядки глаза Шисуи), плюс, так рисковать на обладателе другого МШ дурных вряд ли найдётся. Тот же Саске вполне себе скинул Цукуёми Итачи.