Мне кажется, основных причин того, что маги таки не поработили маглов, две.

Первая - магов тупо очень мало. С конкретными цифрами в каноне та еще лажа, но в любом случае они осоставляют незначительный процент населения Великобритании, и по косвенным данным можно предположить, что в других странах дела обстоят примерно так же. И бОльшая часть этого незначительного процента - это обычные обыватели, те, кто вынужден покупать мантии работы близнецов, потому что сам так и не научился накладывать то же Протего, те, кого легче легкого сбить с толку ложью в газетке, и кому, сюрприз, значительно проще скрывать свои способности, чем пытаться выжить в ситуации охоты на ведьм (которая непременно возникгет, если маги попробуют совершить каминг-аут и в открытую взять власть). Представить условного темного лорда, который "поработил" маглов, заняв ключевой пост в их правительстве и расставив на другие посты своих приспешников, можно. Но представить слившееся общество, где маги составляют элиту, а маглы - массу покоренных хаусниггеров, - нельзя. Это нереалистично же.

Вторая - маги, даже работники министерства, которым вроде как по должности положено, довольно хреново знают маглов. И не горят желанием свое невежество ликвидировать: на кой, если и так сойдет, а на случай, если не сойдет, есть обливиэйт и конфундус. А, меж тем, это может ой как сильно осложнить задачу захвата власти. Даже в прямом силовом столкновении: даже если ты крут и реально можешь трансфигурировать оружие в полено, поди сходу разберись, какая из этих магловских штук - оружие, и на какую опасность реагировать в первую очередь. Вон, даже Глаша с ее идеей растяжек: сильно подозреваю, что для среднестатистичечкого мага растяжка, пока не бахнет, будет выглядеть как обычный магловский мусор. А уж если столкновение имеет форму скрытой политической игры (куда более вероятный вариант развития событий), то невежам там вообще ловить нечего.